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Sur une installation de Workstation de base, il y a bien les notifications qui se font automatiquement depuis
Logiciels.
Tu peux toujours vérifier dans
Logiciels via le menu hamburger dans
Préférences de mise à jour que l'option est bien active.
Pour le second point tout dépend de l'utilisation que tu fais de ton OS et des besoins que tu as.
Le plus sûr et recommandé par le projet Fedora est de les réaliser par
Logiciels car celui-ci va redémarrer pour faire les mises à jour et appliquer les différents scripts avant le prochain démarrage des services.
L'utilisation de
DNF fonctionne aussi mais il faudra un peu plus vérifier ce qu'il se passe.
N'hésite pas à consulter les articles de la Documentation
https://doc.fedora-fr.org/ pour te familiariser avec Fedora Linux.