Pour commencer je regarderai si ce n'est pas non plus simplement un problème d'espace disque avant tout :
sudo df -h
Parce que bon cette ligne m'y fait penser :
[ 3.879698] systemd-journald[643]: Failed to open system journal: No space left on device
Surtout le "/var"
Après si ce n'est pas le cas il est possible que ce soit simplement un soucis avec selinux, voir carrément un souci avec tes unités de stockage.
(Ne pas mettre "sudo" si tu es en root!)
Un chti :
sudo touch ./autorelabel && sudo reboot
(cela peut être long) pour voir si ce n'est pas simplement selinux qui bloque (on peut aussi le désactiver, mais ce n'est pas trop conseillé normalement... Sauf les 3/4 des docs qui le désactive pour "pas se faire chier").
Au pire cela ne fait pas de mal
Et un chti :
sudo dnf install smartmontools -y
Et en remplaçant X par la lettre de ton unités de stockage dont tu nous retournera le rapport pour chacune d'entre elles :
sudo smartctl -aA /dev/sdX
Cela ne fera pas de mal et permettra d'omettre des soucis avec les unités de stockage...