Le plus simple quand on veut editer un service systemd c'est de passer par :
systemctl edit fancontrol
Et d'y mettre juste ce qu'on veut ajouter/changer, en précisant quand même la section concernée. Donc ici
[Service]
Restart=always
Ce qui permet de créer un fichier override.conf au bon endroit (dans /etc/systemd/system/fancontrol.service.d me semble).
Et évite le daemon-reload
Car là j'ai peur que tu ai en réalité modifié le fichier dans /usr/lib/systemd etc ce qui risque de disparaitre à la prochaine mise à jour du rpm.