J'ai résolu le problème en suivant le conseil de passer à la version 0.8 de fedup. Dans le détail cela donne:
# yum --enablerepo=updates-testing update fedup
# fedup --clean
# fedup-cli --network 20 --nogpgcheck
# reboot
# yum clean all
# yum distribution-synchronization
l'option --disablepresto proposée par la
doc ne fonctionne pas ...
Il a supprimé 2 packages et est revenu à la version précédente sur 26 autres
# package-cleanup --cleandupes
# package-cleanup --orphans
Là il m'a trouvé quelques paquets de kernel et des kmod orphelins que j'ai supprimé
Il me reste des paquets fc19 mais je vais voir à l'usure si ils sont mis à jour.