Par principe, tu ne peux toucher une partition qui est montée, sinon c'est un peu le meilleur moyen pour tout casser.

Donc un live-CD de gparted, ou un live-cd/usb de Fedora où tu installes gparted, mais pense bien à faire tes sauvegardes avant!!

Apparemment ton /home est sur une partition séparée. Donc tu peux faire la manip si tu te log sous root et qu'aucun proces d'utilisateur n'est lancé. Tu démontes la partition et tu fais l'opération. Ensuite à toi de gérer selon que ton /home est ou non dans un lvm.