Bon, en regardant le readme, j'ai pu voir que ce n'est pas une vrai compilation.
Il faut aller sur la page que tu m'as indiqué, télécharger nixnote-1.5_amd64.tar.gz.
Ensuite tu décompresses l'archive, cela va te donner un dossier nixnote, ensuite tu te met en root, tu vas dans ce dossier et tu lances
./install.sh
Une fois installé, tu peux lancer nixnote sous ton user avec
/usr/share/nixnote/nixnote.sh