Alors,
Ce qu'il faut comprendre c'est que Linux comme Windows (d'en une certaine mesure) n'utilise pas le login de l'utilisateur pour "reconnaitre" un utilisateur.
Un utilisateur Linux a un identifiant unique : son UID.
Qaund tu ecris sur un montage Samba depuis un Windows, les fichiers sont écris avec le UID/GID de l'utilisateur Windows, mais pas de l'utilisateur Samba.
Pour vérifier si je ne fais pas fausse piste, pourrais tu s'il te plait faire la chose suivante :
ls -n dans le répertoire ou les fichiers appartiennent à "comptabilite" et renvoyer une extrait.
Puis le resultat de
cat /etc/passwd | grep Comptabilite
et de
cat /etc/passwd | grep Bertrand
Ensuite donne les UID de tes utilisateurs Windows
http://support.microsoft.com/kb/154599/en-us