Je ne connais pas Igor mais j'utilise
GNUPlot pour le traitement de mes données. Bon par contre de base il est en ligne de commande, ce qui permet de faire des scripts. Il existe cependant un projet pour avoir une GUI :
JVG mais je ne l'ai jamais essayé.
Si tu as besoin de faire des stats avancées sur tes données, je te conseil de regarder du côté de
R qui est vraiment très puissant.
J'ai essayé QTiPlot il ya quelques temps, mais il ne m'a pas convaincu (juste un sentiment personnel).