Bon, problème résolu en réfléchissant un peu...
Ma F18 n'a pas été installé avec un DVD de F18, mais c'est une F17 mise à jour vers la F18 en activant les dépôts rawhide au début, et ensuite avec les dépôts F18 (j'ai donc bien une F18, n'ayant plus de paquets F17...).
Je me suis dit qu'il devait peut-être traîner une configuration F17 dans initramfs, alors je l'ai régénéré avec les commandes, en root :
mv /boot/initramfs-$(uname -r).img /boot/initramfs-$(uname -r)-bak.img
dracut /boot/initramfs-$(uname -r).img $(uname -r)
Pour plus de sécurité, j'ai aussi régénéré le grub.cfg avec la commande :
grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg
Au redémarrage, je n'ai plus les warnings, je pense que c'est bon maintenant...
Mon explication est peut-être bancale, si quelqu'un en a une meilleure, je suis preneur...
Je passe en résolu.