Bonjour,
Je n'ai plus de Fedora 16 sous la main pour le vérifier, mais il me semble que la commande suivante permet de fixer à la reconnexion le nombre d'espaces de travail:
$ gconftool-2 -t int -s /apps/metacity/general/num_workspaces 4
Si ce n'est pas le cas, tu peux toujours jeter un oeil du côté des extensions gnome-shell, sur
Frippery Static Workspaces par exemple.
En complément avec des espaces de travail fixes,
Auto Move Windows peut être intéressante.
La première fonctionnalité est disponible par défaut sur Fedora 17 via gnome-tweak-tool.