Sur mon pc, j'avais un pb de boot assez inexpliqué également avec fedora core 3.
J'ai mis à jour le bios de ma machine et cela a corrigé le pb immédiatement.
Tu as peut être le même genre de pb, car je ne vois pas ce qui gènerait le système dans ton cas.
Va voir du coté de ton constructeur, et lis les descriptifs des mises à jours de bios.
http://www.fujitsu-siemens.com/support/downloads_1.html
Ils expliquent ce qui a changé d'une version à une autre, tu y trouvera peut être une correction de l'usb...
Bonne chance 🙂