je reprend un peu ce qui a été dit:
pour la copie du /home (ubuntu vers fedora)
cp -R /oldhome /newhome
changement des droits
chown -R 500:500 /home/user
en vérifiant que ton user a bien l'uid 500.
pour expliquer ma question à nouvo09, je voulais savoir si le dossier /home/user sur fedora (qui ne contient aucun fichier personnel pour le moment mais certainement les fichiers de config de base) peut être supprimer pour le remplacer par le /home/user en provenance de ubuntu sans risque. Mon idée étant de remplacer un dossier par un autre et changer les droits.
j'espère que c'est plus clair.
Sinon je stock le /home/user (ubuntu) intégralement dans un dossier et je récupère les dossiers qui m'intéresse (documents, images, .mozilla .thunderbird, etc) dans /home/user (fedora) mais nécessite de faire le tri.
Merci à tous pour vos réponses.