Hé bé ! rien que ça !! :-D
En faisant de simples recherches avec la fonction recherche du forum je pense que tu aura déjà pas mal de réponses !
Sinon, si certaines icônes n'apparaissent pas dans le menu application, c'est parce que les raccourcis-icônes n'ont pas été fait, comme sous win où tu n'a pas forcément tous les raccourcis.
Plus largement, toutes applications peut-être lancé via sa ligne de commande, le fait qu'elle soit graphique où non n'a rien à voir au fait des raccourcis.
Consulte également la faq non officiel de fedora, tu pourra ainsi en apprendre plus sur FC3.
http://perso.wanadoo.fr/fester/faq-fedora.html