Si le déplacement du .gnome a pas suffit je te dirait alors d'essayer de voir avec metacity.
Un find me donne :
$ find . -name metacity
./.gconf/apps/metacity
./.config/metacity
Essayer de les déplacer et de récupérer ceux d'un utilisateur lambda pour voir. En espérant que tu vois le message avant de partir !