Pourquoi ntfs ?
Voir ici
Fat32 et là
NTFS.
Si ntfs est obligatoire pour les disques système de XP, Vista, ce n'est absolument pas nécessaire pour des partitions de données.
ntfs gère des droits par utilisateurs (mais pas FAT32), mais sur un disque externe, donc connectable sur des systèmes window$ différents ne peut que poser des problèmes (à moins d'utiliser 'tout le monde', mais alors pas vraiement besoin de ntfs) .
Ntfs est journalisé (bof! bof!)
Ntfs a moins besoin de défragmentation (bof! bof!)
Quant à installer fedora, cela dépend du bios de la (ou des) machine(s) sur laquelle/lesquelles sera connecté le DD. Il faut que ce bios accepte de booter sur un DD externe.