Il existe une solution simple qui est ce qu'on appelle le "Live-CD". Pour contruire son propre "Live-CD"
http://lea-linux.org/software/cdrtbt.html
Il sera alors possible de stocker ses données sur un disque amovible type USB.
Une solution plus complexe à mettre en oeuvre consiste à booter directement sur le disque USB. Un fil traîte de se sujet, mais la solution n'est pas évidente dans tous les cas.
http://www.fedora-france.org/modules/newbb/viewtopic.php?topic_id=2473&viewmode=flat&order=ASC&start=0
Hope this helps!