En root, c'est pas la place pour conky. Que tu ailles en root en mode graphique pour deux trois opération à la rigueur mais configurer ton environnement graphique root, c'est pas top...
Pour la question de l'alignement de conky, un extrait de mon .conkyrc
.conkyrc est un fichier texte, il n'y a pas de dossier caché de ce nom.
## alignement du texte
#alignment top_left
alignment top_right
#alignment bottom_left
#alignment bottom_right
gap_x 8
gap_y 50
Quand il y a # en début de ligne, c'est un commentaire, conky n'interprête pas cette ligne.
Donc alignment top_right pour aligner en haut à droite...
gap_x et gap_y sont les valeurs du décalage (en pixel) par rapport à l'angle choisi