Ca ne change pas les permissions des autres fichiers, c'est juste pour la fenêtre de pwd root.
J'ai remarqué que ça ne le fait que lorsque je fais la manip sur un "lien vers exécutable" (/usr/bin/yumex et /usr/bin/netgo sont des liens vers leurs homonymes dans /usr/bin/consolehelper et /usr/sbin).
Si par exemple je change les perms pour /usr/bin/yum (qui est un script, pas un raccourci), ça n'a aucun effet sur les autres.
J'ai essayé en console, le comportement est le même, c'est pas propre à nautilus.
J'avoue que j'ai toujours eu un peu de mal avec les liens (symboliques?), mais là ça s'arrange pas...
@bochecha :
Je sais pas si tu as vu pour netgo, tu avais l'air intéressé (voir dernier message de ma part) :
http://forums.fedora-fr.org/viewtopic.php?id=15859