Justement (ok, je n'avais pas vu le _) le Makefile est prévu pour faire une sauvegarde de la config précédente ([ -e $@ ] && mv -f $@ $@.bak;).
Remarque, c'est surtout le .mc qu'il serait judicieux de sauvegarder 🙂
Et en plus le make génèrera le message, si besoin :
Please install package sendmail-cf to update your configuration.
Et le make traite tous les *.cf (sendmail et submit)
A+