Donc est-ce que quelqu'un peut m'assure que de passer à FC5 depuis FC4 n'endommagera pas ma configuration etc ?
Non, personne.
En principe les migrations se passent plutôt bien.
Mais chaque logiciel peut poser des problèmes :
Gnome 2.12 -> 2.14
Firefox 1.0 -> 1.5
Apache 2.0 -> 2.2
MySql 4.1 -> 5.0
etc...
Donc pour chacun des logiciels que tu utilises il faudra vérifier sa configuration.
Dans tous les cas une bonne sauvegarde est indispensable.
Et je partage avec d'autres la préférence d'une réinstallation complète (du système) afin de repartir d'une base propre.
Bonne chance,
A+